Andrea Marcon wurde 1963 in Treviso (Venetien). Er studierte Cembalo und Orgel in Italien und der Schweiz an der Schola Canorum Basiliensis. Er ist Preistraeger bei renommierten Cembalo- und Orgel Wettbewerben  (Bruges, Innsbruck, Bologna). Marcon initiierte 1980 die Sonatori de la Gioiosa Marca, und gruendete 1997 das Venice Baroque Orchestra, das heute eines der weltweit führenden Barockorchester ist. Andrea Marcon hat mehr als 50 CDs  aufgenommen als Dirigent und Solist, die mehrfach ausgezeichnet worden sind mit dem Preisen Echo, Edison, Diapason d'Or, Preis der Deutschen Schallplatten Kritik etc.

In konzertanten Fassungen (Concertgebouw Amsterdam, Carnegie Hall NY, Barbican London, TCE Paris, Baden Baden, Rom etc) und szenisch an Opernhäusern wie Frankfurt, Basel, Venedig, Brooklyn BAM dirigierte er mehrere Opern von Monteverdi, Cavalli, Vivaldi, Galuppi, Haendel, Cimarosa und Boccherini.

Andrea Marcon war Gast bei einigen der wichtigsten Festivals und in den renommiertesten Konzertsälen in Europa, den USA und Japan.

Mit Werken von Mozart, Haydn, Beethoven, Schubert, Mendelssohn  ist er gern gesehener Gastdirigent bei den Sinfonieorchestern des HR, WDR, NDR, Mahler Chamber Orchestra, Mozarteum Orchester, Camerata Salzburg, Bremer Philharmoniker, Orchestra Sinfonica Ciudad de Granada, Orchestra Sinfonica del Principado de Asturias, etc.

Eine enge Zusammenarbeit verbindet ihn mit dem Barockorchester La Cetra in Basel.

Seit 1997 ist Andrea Marcon Professor für Cembalo und Orgel an der Schola Cantorum Basiliensis.